Publications


Papers and books of the Bioflora research group (last 10 years)



Scientific research

In press /under revision:




 2016

 

Shiposah V, Catalan P, Olonova M, Marques I. 2016. Genetic structure and diversity of the selfing model grass Brachypodium stacei (Poaceae) in Western Mediterranean: out of the Iberian Peninsula and into the islands. PeerJ 4:e2407; DOI 10.7717/peerj.2407.

Catalán P. 2016. ¿Por qué es importante investigar en Botánica? Lucas Mallada 17: 9-13.

Catalan P, López-Álvarez D, Bellosta C, Villar L. 2016. Updated taxonomic descriptions, iconography and habitat preferences of Brachypodium distachyon, B. stacei and B. hybridum (Poaceae). Anales del Real Jardín Botánico de Madrid 73 (1): e028 (doi: http://dx.doi.org/10.3989/ajbm.2428).

Viruel J, Segarra-Moragues JG, Raz L, Forest F, Wilkin P, Sanmartin I, Catalán P. 2016. Late Cretaceous – Early Eocene origin of yams (Dioscorea, Dioscoreaceae) in the Laurasian Palearctic and their subsequent Oligocene – Miocene diversification. Journal of Biogeography 43: 750-762.

Catalán P, López-Alvarez D, Díaz-Pérez A, Sancho R, López-Herranz ML. 2016. Phylogeny and evolution of the genus Brachypodium. In Vogel J (ed.). Genetics and genomics of Brachypodium. pp. 9-38. Series Plant Genetics and Genomics: Crops Models. Springer. New York (doi 10.1007/7397_2015_17).

Marques I, Montgomery S, Barker MS, Macfarlane T, Conran J, Catalán P, Rieseberg L, Rudall PJ, Graham SW. 2015. Transcriptome-derived evidence 1 supports recent polyploidization and a major phylogeographic division in Trithuria submersa (Hydatellaceae, Nymphaeales). New Phytologist (doi 10.1111/nph.13755).

Ascaso J, Reiné R, Broca A, Barrantes O, M, Ferrer C. 2016. Características nutricionales de especies de los prados del Pirineo central. In Báez Bernal, M. D.; Campo Ramírez, L.; Pereira, S.; Bande, M. J.; López Díaz, J. E. —Eds.—. Innovación Sostenible En Pastos: Hacia una Agricultura de Respuesta al Cambio Climático. 181-187. Sociedad Española para el Estudio de los Pastos. Lugo-La Coruña. CL

 

 2015


Pérez-Collazos E, Segarra-Moragues JG, Villar L, Catalán P. 2015. Ant pollination promotes spatial genetic structure in the long-lived Borderea pyrenaica (Dioscoreaceae). Biological Journal of the Linnean Society 116: 144-155.


López-Alvarez D, Manzaneda A J, Rey PJ, Giraldo P, Benavente E, Allainguillaume J, Mur LAJ, Caicedo AL, Hazen SP, Breiman A, Ezrati S, Catalán P. 2015. Environmental niche variation and evolutionary diversification of the Brachypodium distachyon grass complex species in their native circum-Mediterranean range. American Journal of Botany 102: 1-16. A

 

Minaya M, Díaz-Pérez AJ, Mason-Gamer R, Pimentel M, Catalán P. 2015. Evolution of the beta-amylase gene in the temperate grasses: non-purifying selection, recombination, semiparalogy, homeology and phylogenetic signal. Molecular Phylogenetics and Evolution 91: 68-85. A

Ascaso J, Yera J. 2015. Flora vascular de la alberca de Loreto. Lucas Mallada, 17: 59-75. A

Ascaso J, Yera J. 2015. Oenothera speciosa Nutt., nuevo taxon para la provincia de Huesca. Bouteloua 22: 241-242. A

Reiné R, Ascaso J, Broca A, Millán A, Barrantes O, Ferrer C. 2015. Valor proteico de especies de prados de siega de montaña del Pirineo central. In Cifre Llompart, J., Janer March, I., Gulías León, J., Jaume Sureda, J. et Medrano Gil, H. —Eds.—. Pastos y Forrajes en el siglo XXI. 121-128. Sociedad Española para el Estudio de los Pastos. Palma de Mallorca. CL

Simon-Porcar VI, Pérez-Collazos E, Catalán P. 2015. Phylogeny and systematics of the western Mediterranean Vella pseudocytisus- V aspera complex (Brassicaceae). Turkish Journal of Botany 39: 472-486. A


Montserrat P, Villar L. 2015. Coriaria. In F. Muñoz Garmendia & al. (eds.) Flora ibérica vol. IX (Rhamnaceae-Polygalaceae), pp. 119-122. Real Jardín Botánico, CSIC, Madrid. CL


Jiménez JJ, Villar L. 2015. Soil variability at GLORIA sites. In Pauli H, Gottfried M, Lamprecht A, Niessner S, Rumpf S, Winkler M, Steinbauer K, Grabherr G (eds). The GLORIA field manual – standard MultiSummit approach, supplementary methods and extra approaches. 5th edition. GLORIA-Coordination, Austrian Academy of Sciences & University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna. pp.79-80. CL


Badía D, Martí C, Casanova J, Gillot T, Cuchí JA, Palacio J, Raúl A. 2015. A Quaternary soil chronosequence study on the terraces of the Alcanadre River (semiarid Ebro Basin, NE Spain). Geoderma. 241-242, pp. 158 - 167. A


Badía D, Orús D, Doz JR, Casanova J, Poch RM, García-González MT. 2015. Vertic features in a soil catena developed on Eocene marls in the Inner Depression of the Central Spanish Pyrenees. Catena. 129 -, pp. 86 - 94. A



2014


Dündar E, Bush D, Catalán P. 2014. Plant phylogenetics and molecular genetics in the new era of genomics. Turkish Journal of Botany 38: i-ii. A


Viruel J, Catalán P, Segarra-Moragues JG. 2014. Latitudinal environmental niches and riverine barriers shaped the phylogeography of the central Chilean endemic Dioscorea humilis (Dioscoreaceae). PlosOne 9(10): e110029. A


 Catalán P, Gonzalez-Candelas F. 2014. Phylogenetic techniques and markers. In: Zardoya R, Vargas P (eds.): The tree of life: systematics and evolution of living organisms. Sinauer. CL

 

Diaz-Pérez A, Sharifi-Tehrani M, Inda LA, Catalán P. 2014. Polyphyly, gene-duplication and extensive allopolyploidy framed the evolution of the ephemeral Vulpia grasses and other fine-leaved Loliinae (Poaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 79: 92-105. A

 

Catalan P, Chalhoub B, Chochois V, Garvin DF, Hasterok R, Manzaneda AJ, Mur LAJ, Pecchioni N, Rasmussen SK, Vogel JP, Voxeur A. 2014. Update on genomics and basic biology of Brachypodium. Trends in Plant Science 19:414-418. A

 

Inda L.A., Sanmartin I, Buerki S, Catalán P. 2014. Mediterranean origin and Miocene-Holocene Old World diversification of meadow fescues and ryegrasses (Festuca subgen. Schedonorus and Lolium). Journal of Biogeography 41: 600-614. A

Ascaso J. 2014. Primulaceae. Catálogo de Plantas y Atlas de la Flora de los Pirineos. Proyecto OPCC-POCTEFA. CBN des Pyrénées et de Midi-Pyrénées, CBN Méditerranéen, Ihobe (Gobierno Vasco), Institut Botànic de Barcelona (CSIC), Instituto Pirenaico de Ecología (CSIC), Museu de Ciències Naturals de Barcelona, Universitat de Barcelona. http://atlasflorapyrenaea.org/florapyrenaea/homepage.jsp.



2013


Torrecilla P, Acedo C, Marques I, Diaz-Pérez AJ, López-Rodríguez JA, Mirones V, Sus A, Llamas F, Alonso A, Pérez-Collazos E, Viruel J, Sahuquillo E, Sancho MC, Komac B, Manso JA, Segarra-Moragues JG, Draper D, Villar L, Catalán P. 2013. Morphometric and molecular variation in concert: taxonomy and genetics of the reticulate Pyrenean and Iberian alpine spiny fescues (Festuca eskia complex, Poaceae). Botanical Journal of the Linnean Society 173: 676-706. A
Inda LA, Wolny E. 2013. Fluorescent in situ hybridization of the ribosomal RNA genes (5S and 35S) in the genus Lolium: Lolium canariense, the missing link with Festuca?. Anales del Jardín Botánico de Madrid 70: 97-102.

 
Pimentel M., Sahuquillo
E., Torrecilla Z., Popp M., Catalán P., Brochmann C. 2013. Hybridizations and long-distance colonizations at
different time scales: towards resolution of long-term controversies in the
sweet vernal grasses (Anthoxanthum). Annals of Botany 112: 1015-1030. A.

 

Minaya M, Pimentel M, Mason-Gamer R, Catalán P. 2013. Distribution and evolutionary dynamics of Stowaway Miniature Inverted repeat Transposable Elements (MITEs) in grasses. Molecular Phylogenetics and Evolution 68: 106-118. A

 

Devesa J, Catalán P, Müller J, Cebolla C, Ortuñez E. 2013. Checklist de Festuca L. (Poaceae) en la Península Ibérica. Lagascalia 33: 183-274. A

 

Catalán P, López-Alvarez D, López-Herranz ML. 2013. Código de barras genético de gramíneas modelo (Brachypodium): incremento de la biodiversidad. Conservación Vegetal17: 3-6. A


Ascaso J, Ortiz D, Ortas L, Yera J. 2013. Sicyos angulatus L. y Abutilon theophrasti medicus en Cantabria (España). Acta Botanica Malacitana, 38: 171-172. A


 

2012


Garnatje T, Pérez-Collazos E, Pellicer J, Catalán P. 2012. Balearic insular isolation and large continental spread framed the phylogeography of the western Mediterranean Cheirolophus intybaceus (Asteraceae). Plant Biology 15: 166-175. A.

 

López-Alvarez D, López-Herranz ML, Betekhtin A, Catalán P. 2012. A DNA barcoding method to discriminate between the model plant Brachypodium distachyon and its close relatives B. stacei and B. hybridum (Poaceae).  PLoS ONE 7(12): e51058. doi:10.1371/journal.pone.0051058 A

 

Triano E, Benavente Navarro A, Catalán P, Hernández P, Pujadas Salvà AJ. 2012. Orobanche lainzii (J. Gómez Navarro et al.) Triano & A. Pujadas comb. nov. (Orobanchaceae) en Andalucía oriental (España).  Acta Botanica Malacitana 37: 224-225. A

 

Catalán P., Müller J. 2012. Festuca L., in Zuloaga F. et al (eds.). Flora de Argentina. CONICET. Buenos Aires. vol. 3, tomo II: 219-250. CL

 

Girón V, Garnatje T, Vallés J, Pérez-Collazos E, Catalán P, Valdés B. 2012. Geographical distribution of diploid and tetraploid cytotypes of Thymus sect. Mastichina(Lamiaceae) in the Iberian Peninsula: genome size and evolutionary processes.  Folia Geobotanica 47: 441-460. A

 

Diaz-Pérez A, Sequeira M, Santos-Guerra A, Catalán P. 2012. Divergence and biogeography of the recently evolved Macaronesian red Festuca(Gramineae) species inferred from coalescence-based analyses. Molecular Ecology 21: 1702-1726. A

 

Catalán P, Müller J, Hasterok R, Jenkins G, Mur LAJ, Langdon T, Betekhtin A, Siwinska D, Pimentel M, López-Alvarez D. 2012. Evolution and taxonomic split of the model grass Brachypodium distachyon (L.) P. Beauv. Annals of Botany 109: 385–405. A

 

Viruel J, Catalan P, Segarra-Moragues JG. 2012. Disrupted phylogeographical microsatellite and cpDNA patterns indicate a vicariance rather than long-distance dispersal origin for the disjunct distribution of the Chilean endemic Dioscorea biloba(Dioscoreaceae) around the Atacama Desert. Journal of Biogeography 39: 1073-1085. A

 

.- Inda L.A., Pimentel M. and Chase M.W. 2012. Phylogenetics of tribe Orchideae (Orchidaceae; Orchidoideae) based on combined DNA matrices: inferences regarding timing of diversification and evolution of pollination syndromes. Annals of Botany 110:71-90. A



2011


Segarra-Moragues JG, Catalan P. 2011. Characterization of microsatellite loci in Festuca gautieri (Poaceae) and transferability to F. eskia and F. × picoeuropeana. American Journal of Botany, AJB Primer Notes & Protocols in the Plant Sciences (e-proof).

 

Catalán P. 2011. 23. Festuca L., in Blanca G., Cabezudo B., Cueto M., Morales-Torres C., Salazar C. (eds.): Claves de la Flora Vascular de Andalucía Oriental. pp. 128-133. Universidades de Granada, Almería, Jaen y Málaga. Granada. CL

 

Villar L., Segarra-Moragues JG, Minaya MA, Pérez-Collazos E, Viruel J, Catalán P. 2011. El valle del Ebro (yesos monegrinos) y territories colindantes. In: Mota JF, Sánchez-Gomez P, Guirado JS (eds.): Diversidad vegetal de las yeseras ibéricas. El reto de los archipiélagos edáficos para la conservación, pp. 361-366. ADIF – Mediterráneo Asesores Consultores. Almería. CL.

 

Pérez-Collazos E., Catalán P. 2011. Capítulo 7: Genética de poblaciones. In: Moreno JC, Guzman D, Domínguez F. (eds). Biología de la conservación de Vella pseudocytisus subsp. paui, una planta amenazada en Aragón, pp. 163-185. Consejo de Protección de la Naturaleza en Aragón. Zaragoza. CL.

 

Mur L., Allainguillaume J., Catalán P., Hasterok R., Jenkins G., Lesniewska K., Thomas I., Vogel J. 2011. Exploiting the Brachypodium Tool Box in cereal and grass research. New Phytologist 191: 334-347.

 


2010


Viruel J, Catalan P, Segarra-Moragues JG. 2010. New microsatellite loci in the dwarf yams Dioscorea group Epipetrum (Dioscoreaceae). American Journal of Botany, AJB Primer Notes & Protocols in the Plant Sciences: e121-e123, http://www.amjbot.org/, doi:10.3732/ajb.1000304


Pérez-Collazos E., Sánchez S, Barriuso J.J., Palazón C. 2010. Molecular Identification of Truffles. Atti 3 congtresso internazionale di Spoleto sul Tartufo. pp: 122-129. A     

 

Pimentel M., Catalán P., Sahuquillo E. 2010. Morphological and molecular taxonomy of the annual diploids Anthoxanthum aristatum and A. ovatum (Poaceae) in the Iberian Peninsula. Evidence of introgression in natural populations. Botanical Journal of the Linnean Society 164: 53-71. A


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Ascaso J, Alcubilla M, Broca A, Maestro M, Ferrer, C. 2010. Relaciones entre comunidades vegetales y sustrato edáfico en pastos de puerto del Pirineo central. In Calleja et al. —Eds.—. Pastos: fuente natural de energía. 49-56. Sociedad Española para el Estudio de los Pastos. Área de Publicaciones. Universidad de León. CL

 

Müller J, Catalán P. 2010. A new rhizomatous species of Festuca L. (Poaceae-Poeae) from northwestern Argentina. Darwiniana 48: 87-92. A

 

Quintanar A., Catalán P., Castroviejo S. 2010. A review of the systematics and phylogenetics of the Koeleriinae (Poaceae: Poeae), in Seberg O, Petersen G, Barfod & Davis JD (eds.): Diversity, phylogeny and evolution in the monocotyledons, pp. 539-556.  Aarhus University Press. Aarhus. CL

 

Segarra-Moragues JG, Catalán P. 2010. The fewer and the better: prioritization of populations for conservation under limited resources, a study with Borderea pyrenaica (Dioscoreaceae) in the Pyrenean National Park. Genetica 138: 363-376. A

 

Viruel J., Segarra-Moragues JG., Pérez-Collazos E., Villar L., Catalán P. 2010. Systematic revision of the Epipetrum, Group of Dioscorea (Dioscoreaceae) endemic to Chile. Systematic Botany 35: 40-63. A

 

Inda L.A., Pimentel M., Chase M.W. 2010.  Chalcone synthase variation and phylogenetic relationships in Dactylorhiza (ORCHIDACEAE).Botanical Journal of the Linnean Society, 163: 155-165. A

 

Inda L. A., Pimentel M., Chase M.W.  2010. Contribution of mitochondrial cox1 intron sequences to the phylogenetics of tribe Orchideae (Orchidaceae): Do the distribution and sequence of this intron in orchids also tell us something about its evolution?. Taxon, 59: 1054-1064. A

  


2009


Ortega-Olivencia A., Catalán P. 2009. Systematics and evolutionary history of the circum-Mediterranean genus Anagyris L. (Fabaceae) based on morphological and molecular data. Taxon 58: 1290-1306. A

 

Mota JF, Sanchez-Gomez P, Merlo ME, Catalan P, Laguna E, de la Cruz M, Navarro FB, Marchal F, Bartolomé C, Martínez JM, Sainz-Ollero H, Valle F, Serra L, Martínez F, Garrido JA, Pérez-

García FJ. 2009. Aproximación a la checklist de los gipsófitos ibéricos. Anales de Biología (Universidad de Murcia) 31: 71-80.

 

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Sharifi-Tehrani M., Mardi M., Sahebi J., Díaz-Pérez A., Catalán P. 2009. Genetic diversity and structure among Iranian tall fescue phenotypes based on SSR and EST-SSR marker analysis. Plant Systematics and Evolution 282: 57-70. A

 

Viruel, J.; Segarra-Moragues, J.G.; Pérez-Collazos, E.; Catalán, P.; Villar, L.; Díaz-Lifante, Z.; Valdés, B.; Müller, J. 2009. Proposal to reject the name Luzuriaga cordata (Dioscoreaceae). Taxon 58: 1007. A

 

Sequeira M, Diaz-Pérez A, Santos-Guerra A, Catalán P. 2009. Karyological analysis of the five native Macaronesian Festuca (Gramineae) grasses supports a distinct diploid origin of two schizoendemic groups. Anales del Jardín Botánico de Madrid 66:55-63. A

 

Catalán P., Soreng R.J., Peterson P.M. 2009. Festuca aloha and F. molokaiensis (Poaceae: Loliinae), two new species from Hawai‘i. Journal of the Botanical Research Institute of Texas 3: 51-58. A

 

Pérez-Collazos E., Sánchez-Gómez P., Jiménez JF, Catalán P. 2009. The phylogeographic history of the Iberian steppe plant Ferula loscosii(Apiaceae): a test of the Abundant-centre hypothesis. Molecular Ecology 18: 848-861. A


Alcubilla M, Ascaso JR, Broca A, Maestro M, Ferrer C. 2009. Suelos de pastos de puerto en el Pirineo Central y su relación con la vegetación. In Reiné R, Barrantes O, Broca A, Ferrer, C. —Eds.—. La multifuncionalidad de los pastos: producción ganadera sostenible y gestión de ecosistemas. 69-76. Sociedad Española para el Estudio de los Pastos. Huesca. CL

 

Yera J, Ascaso J. 2009. 6210 Pastos vivaces mesofíticos y mesoxerofíticos sobre sustratos calcáreos de Festuco-Brometea. En: VV.AA., Bases ecológicas preliminares para la conservación de los tipos de hábitat de interés comunitario en España. Dirección General de Medio Natural y Política Forestal, Ministerio de Medio Ambiente, y Medio Rural y Marino. Madrid. CL

 

Yera J, Ascaso J. 2009. De plantis vascularibus praesertim ibericis, V. Flora Montiberica, 43: 10-18. A

 

2008

 

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Cano-Maqueda J., Talavera S., Arista M., Catalán P. 2008. Speciation and biogeographical history of the Campanula lusitanica complex (Campanulaceae) in the western Mediterranean region. Taxon 57: 1252-1266. A

 

Viruel J., Segarra-Moragues JG., Pérez-Collazos E., Villar L., Catalán P. 2008. The diploid nature of the Chilean Epipetrum and a new base number in the Dioscoreaceae. New Zealand Journal of Botany 46: 327-339. A

 

Diaz-Pérez A, Sequeira M, Santos-Guerra A, Catalán P. 2008. Multiple colonizations, in-situ speciation, and volcanism-associated stepping-stone dispersals shaped the phylogeography of the Macaronesian red fescues (Festuca L., Gramineae). Systematic Biology 57: 732-749. A

 

Inda LA., Torrecilla P., Catalán P., Ruiz-Zapata T. 2008. Phylogeny of Cleome L. and its close genera Podandrogyne Ducke and PolanisiaRaf. (Cleomoideae, Cleomaceae) based on analysis of nuclear ITS sequences and morphology. Plant Systematics and Evolution 274: 111-126. A

 

Pérez-Collazos E., Catalán P. 2008. Conservation genetics of the endangered Iberian steppe plant Ferula loscosii (Apiaceae). Plant Biology10: 492-501. A

 

Pérez-Collazos E., Segarra-Moragues J.G., Catalán P. 2008. Two approaches for the selection of Relevant Genetics Units for Conservation (RGUCs) in the narrow European endemic steppe plant Boleum asperum (Brassicaceae). Biological Journal Linnean Society 94: 341-354. A

             

Inda LA, Segarra-Moragues JG, Müller J, Peterson PM, Catalán P. 2008. Dated historical biogeography of the temperate Loliinae (Poaceae, Pooideae) grasses in the northern and southern hemispheres. Molecular Phylogenetics and Evolution 46 (3): 932-957. A

 


2007


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Pérez-Collazos E., Catalán P. 2007. Genetic diversity analysis and conservation implications for the threatened populations of the irano-turanian relict Krascheninnikovia ceratoides (Chenopodiaceae). Biological Journal of the Linnean Society 92: 419-429. A

 

Segarra-Moragues JG, Villar L, López J, Pérez-Collazos E, Catalán P. 2007. A new Pyrenean hybrid Cirsium (Asteraceae) as revealed by morphological and molecular analyses. Botanical Journal of the Linnean Society 154: 421-434. A

 

Segarra-Moragues, J.G.; Palop-Esteban, M.; González-Candelas, F.; Catalán, P. 2007. Nunatak survival versus tabula rasa in the Central Pyrenees, a study on the endemic plant species Borderea pyrenaica (Dioscoreaceae). Journal of Biogeography 34: 1893-1906. A

 

Pimentel M., Sahuquillo E., Catalán P. 2007. Genetic diversity and spatial correlation patterns unravel the biogeographical history of the European sweet vernal grasses (Anthoxanthum L., Poaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 44: 667-684. A

 

Quintanar A., Castroviejo S., Catalán P. 2007. Phylogeny of Aveneae (Poaceae) inferred from nuclear and plastid DNA sequence analysis.American Journal of Botany 94: 1554-1569. A

 

 Pérez-Collazos E., Segarra-Moragues J.G., Inda L. A., Catalán P. 2007. Population genetics and the conservation status of the threatened Iberian steppe grass Puccinellia pungens (Pau) Paunero. Botanical Journal Linnean Society 154: 269-281. A

 

 Catalán, P., Torrecilla P., López-Rodríguez, J.A. , Müller, J., Stace, C. A. 2007. A systematic approach to subtribe Loliinae (Poaceae: Pooideae) based on phylogenetic evidence, pp. 380-405, In J. T. Columbus, E. A. Friar, J. M. Porter, L. M. Prince, and M. G. Simpson , Monocots: Comparative Bbiology and Evolution - Poales.  Rancho Santa Ana Botanic Garden, Claremont, California, USA.

.CL

 


2006


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Catalán, P., Torrecilla P., López-Rodríguez, J.A., Müller, J. 2006. Molecular evolutionary rates shed new lights on the relationships ofFestuca, LoliumVulpia and related grasses (Loliinae, Pooideae, Poaceae), in Bailey, J. P. and Ellis R. G. (eds.). Current Taxonomic Research on the British & European Flora. pp. 45-70. Botanical Society of the British Isles. London. CL

 

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Catalán P, Segarra-Moragues JG, Palop-Esteban M, Moreno C, Gonzalez-Candelas F., 2006. A Bayesian approach for discriminating among alternative inheritance hypotheses in plant polyploids: the allotetraploid origin of genus Borderea (Discoreaceae). Genetics 172: 1939-1953.

 

Pérez-Collazos E, Catalán P. 2006. Palaeopolyploidy, spatial structure and conservation genetics of the narrow steppe plant Vella pseudocytisus  subsp. paui (Vellinae, Cruciferae). Annals of Botany 97: 635-647. A

 

Inda LA, Aguirre-Hudson B. 2006. Mariano La Gasca en el exilio inglés (1824-1834). Revista de la Real Academia de Ciencias de Zaragoza, 61: 135-146. A.

  


2005


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